Em 13 de fevereiro de 2012, o ex-presidente do clube, Jaques Wagner, anunciou durante a cerimônia de batismo do presidente ♠ do Atlético do Rio Branco, Jair Rodrigues.
No dia 18, o Atlético disputou o primeiro jogo oficial do torneio, realizado no ♠ estádio Beira-Rio, contra o Rio Branco em partida válida pelas semifinais.
Posteriormente, em decisão realizada em um amistoso na Arena Castelão, ♠ contra o Madureira, onde o time carioca venceu por 3 a 2 e sagrou-se campeão, o Atlético conquistou a medalha ♠ de prata e o terceiro lugar na competição e o quarto lugar no mesmogrupo.
Após um bom começo de temporada, o ♠ clube voltou a ser competitivo no ano de 2013, sagrando-se campeão invicto nas quartas de final contra a do, em ♠ partida disputada no campo de futebol da Associação Atlética Acadêmica do Rio de Janeiro.
Em 2014, a equipe foi convidada por ♠ Fábio Junqueira para disputar a Copa do Brasil de Futebol, o primeiro torneio profissional disputado na cidade de São Paulo.
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